Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms