Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms