Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFVQ71UI9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2AFVQ71UI9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms