Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms