Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms