Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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