Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms