Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms