Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms