Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC93Q567U6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC93Q567U6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC93Q567U6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC93Q567U6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC93Q567U6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms