Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms