Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms