Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC58Q4VC31 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC58Q4VC31 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms