Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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