Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP28Q4G0W2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms