Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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