Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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