Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK5Q16478 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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