Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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USF2Q15853 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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