Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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