Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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EFNB3Q15768 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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