Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SF1Q15637 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SF1Q15637 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SF1Q15637 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SF1Q15637 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SF1Q15637 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SF1Q15637 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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