Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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