Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PUM3Q15397 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PUM3Q15397 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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