Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NECTIN1Q15223 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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