Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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