Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBR1Q14596 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms