Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms