Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FHL3Q13643 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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