Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms