Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms