Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TUBB3Q13509 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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