Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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