Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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