Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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