Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SEMA3BQ13214 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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