Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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