Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CHAF1BQ13112 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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