Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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