Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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