Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FOXF2Q12947 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FOXF2Q12947 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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