Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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