Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms