Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms