Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms