Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms