Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL16A1Q07092 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL16A1Q07092 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms