Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms