Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms