Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms